ลำดับเบสบางส่วนของยีน rbcL ในสมุนไพรกลุ่มจันทน์ในจังหวัดจันทบุรี

Main Article Content

Chawanrat Somnuek
Phisut Kanboon

บทคัดย่อ

การหาลำดับเบสบางส่วนของยีน rbcL (ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit)  ในสมุนไพรกลุ่มจันทน์ 5 ชนิด ได้แก่ จันทน์ชะมด จันทน์เทศ จันทนา จันทน์แดง และจันทน์ขาว ที่พบในจังหวัดจันทบุรี โดยเก็บตัวอย่างใบอ่อนจากต้นจันทน์ที่มีชื่อเรียกในท้องถิ่นต่าง ๆ มาสกัดดีเอ็นเอและเพิ่มจำนวนบริเวณยีนด้วยเทคนิคพีซีอาร์ จากนั้นวิเคราะห์หาลำดับเบสและนำข้อมูลลำดับเบสเปรียบเทียบกับข้อมูลทางพันธุกรรมที่ปรากฏในฐานข้อมูล GenBank พบว่า ทุกตัวอย่างที่ศึกษาสามารถเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอบริเวณยีน rbcL ได้ โดยลำดับเบสที่วิเคราะห์ได้เมื่อพิจารณาร่วมกับลักษณะทางพฤกษศาสตร์ในตัวอย่างจันทน์ชะมด จันทน์เทศ จันทนา มีความสอดคล้องกับ Aglaia sp. (99.08%), Myristica fragrans (99.89%) และ Tarenna buruensis (98.69%) ตามลำดับ ส่วนจันทน์แดงจำนวน 2 ตัวอย่าง สอดคล้องกับพืชกลุ่มจันทน์ผา (Dracaena cambodiana) (99.48%) และ Knema sp. (99.43%) ส่วนจันทน์ขาว สอดคล้องกับ Luehea paniculate (98.89%)

Article Details

บท
Original Articles

References

Sapakhun S, Chaleanlap K, Boonreung S, Panbamrung P, Kiedkangvanklai A, Ananwarapong P, Chamniensri

C, Klinthong N. The study of biodiversity of mangrove forests in the Pak Nam Welu area, Khlung District, Chanthaburi Province. In research report of Rajamangala University of Technology Krungthep. Bangkok: 2007. (in Thai)

National Parks Research Center. Biodiversity of forests and wildlife in the ecological corridor between Khao

Khitchakut national park and Khao Soi Dao wildlife sanctuary, Chanthaburi province. In national park research

report 13(4). National Park Innovation and Research Center, Phetchaburi Province, Phetchaburi: 2016. p.

-30. (in Thai)

Notification of the Ministry of Public Health. Management plan for protecting herbs in Phu Pha Kood conservation area, Mukdahan province: According to the protection and promotion of Thai traditional medicine knowledge protection and promotion act traditional Thai medicine wisdom 1999. Ministry of Public Health, Bangkok: 2008. (in Thai)

Database of Plants in the Project due to the Initiative of the Chaipattana Foundation. Gold apple. [Internet]. n.d. [cited 2020 July 1]; Available from: http://punmai.chaipat.or.th/view-detail.php?region=2&pid=21&id=89. (in Thai)

Srisopon S, Burana-osot J, Sotanaphun U. Identification of Chan-Chamot by Thin Layer Chromatography. Thai

Bulletin of Pharmaceutical Sciences. 2016;11(1):47-57. (in Thai)

Medthai. Chan Thet: 54 properties and benefits of Chan Thet and Look Chan. [Internet]. 2017 [cited 2021 March 4]: Available from: https://medthai.com/จันทน์เทศ (in Thai)

Picheansoonthon C, Manmas C, Jeerawong V. Description of the Phra Narai Vishnu in honor of the 72nd Anniversary of the Maharaja, December 5, 1999. Bangkok: Amarin Printing and Publishing; 2015. (in Thai).

Gardner S, Sitthisoontorn P, Chayamarit K. Forest trees of Southern Thailand. Bangkok: Kobfire printing project; 2016. (in Thai).

Plunkett GM, Soltis DE, Soltis PS. Clarification of the relationship between Apiaceae and Araliaceae based

on matK and rbcL sequence data. American Journal of Botany. 1997;84:565-80.

Hollingsworth PM, Forrest LL, Spouge JL, Hajibabaei M, Ratnasingham S, van der Bank M, Chase MW, Cowan RS, Erickson DL, Fazekas AJ, Graham SW, James KE, Kim KJ, Kress WJ, Schneider H, van Alphen Stahl J, Barrett

SC, van den Berg C, Bogarin D, Burgess KS, Cameron KM, Carine M, Chacón J, Clark A, Clarkson JJ, Conrad

F, Devey DS, Ford CS, Hedderson TA, Hollingsworth ML, Husband BC, Kelly LJ, Kesanakurti PR, Kim JS, Kim

YD, Lahaye R, Lee HL, Long DG, Madriñán S, Maurin O, Meusnier I, Newmaster SG, Park CW, Percy DM, Petersen

G, Richardson JE, Salazar GA, Savolainen V, Seberg O, Wilkinson MJ, Yi DK, Little DP. A DNA barcode for land

plants. 2009;PNAS106(31):12794-7.

Monkhrang P, Chaveerach A, Tanee T, Sudmoon R. DNA Barcode for Identification of Processes Medicinal Senna species. KKU Research Journal. 2013;13(2):18-30. (in Thai)

Rozen S, Skaletsky H. Primer3 on the WWW for general users and for biologist programmers, In: Krawetz S,

Misener S, editors. Bioinformatics methods and protocols: methods in molecular biology. Totowa, New Jersey:

Humana Press; 2000.

Committee for Thai Herbs Textbook. Chan Thang Song. Journal of Thai Traditional & Alternative Medicine.

;15(1):104-16.

Forest Herbarium. Concise encyclopedia of plants in Thailand. [Internet]. 2016. [cited 2019 May 30]; Available

from: https://www.dnp.go.th/botany/detail.aspx?words=จันทน์ชะมด&typeword=group (in Thai)

BGO Plant Database, The Botanical Garden Organization. Medicinal plants database. [Internet]. 2011 [cited

January 12]; Available from: http://www.qsbg.org/Database/plantdb/mdp/medicinal-specimen.asp?id=729

(in Thai)

Medthai. Chan Pha: 26 Properties and benefits of Chan Pha. [Internet]. 2017 [cited 2020 April 7]: Available from: https://medthai.com/จันทน์ผา/ (in Thai)

Plant Genetic Conservation Project Under The Royal initiative of Her Royal Highness Princess Maha Chakri

Sirindhorn. Plant data. [Internet]. n.d. [cited 2020 May 10]: Available from: http://www.rspg.or.th/plants_data/

palace/chitralada/cld6-2_092.htm (in Thai)

Srisopon S, Burana-osot J, Sotanaphun U. Botanical identification of Chan-Khao and Chan-Thana by Thin-

Layer Chromatography. Thai Pharmaceutical and Health Science Journal. 2015;10(1):19-24. (in Thai)

Smitinand T. Thai plant names (botanical names–vernacular names). Forest Herbarium, Royal Forest Department, Bangkok: 1980. (in Thai)

Picheansoonthon C, Wichai N. The botanical source of Chan-Deang. The Journal of the Royal Society of Thailand. 2004;29(1):25-35. (in Thai)

Thanananta N, Sumrith J, Thanananta T. Analysis of genetic relationship of colored rice cultivars using DNA

sequences of rbcL and rpoC1 genes. Thai Science and Technology Journal. 2014;22(5)(Special Issue):674-82.

(in Thai)

Krishnamurthy K, Francis RA. A critical review on the utility of DNA barcoding in biodiversity conservation.

Biodiversity and Conservation. 2012;21(8):1901-19.