การคัดแยก และระบุชนิดด้วยวิธีทางอณูชีววิทยาของเชื้อวิบริโอและแบคทีเรียก่อโรคทางเดินอาหาร จากร้านอาหารทะเลริมทาง จังหวัดบุรีรัมย์
คำสำคัญ:
อาหารทะเล , แผนภูมิต้นไม้, แบคทีเรียก่อโรคในระบบทางเดินอาหาร , วิบริโอ, 16เอสไรโบโซมอลอาร์เอ็นเอบทคัดย่อ
การคัดแยกและระบุเชื้อวิบริโอ และแบคทีเรียก่อโรคในทางเดินอาหารที่ปนเปื้อนในอาหารทะเล ใช้วิธีการสุ่มเก็บตัวอย่างอาหารทะเลจากร้านค้าริมทาง จำนวน 5 ร้านค้าในอำเภอเมือง จังหวัดบุรีรัมย์ การแยกโคโลนีของแบคทีเรียใช้วิธีเพาะเลี้ยงในอาหารวุ้น TCBS ที่มีความจำเพาะต่อการเจริญเติบโตของชนิดแบคทีเรีย การเพิ่มจำนวนยีน 16S rRNA ในแต่ละโคโลนีใช้ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลิเมอเรส และวิเคราะห์ด้วยวิธีชีวสารสนเทศ การกำหนดสายพันธุ์ และสปีชีส์ของแบคทีเรีย ใช้วิธีการ BLASTN และอ้างอิงฐานข้อมูลของ GenBank โดยใช้ค่าร้อยละความเหมือน และคะแนนรวมจาก BLASTN จากการวิเคราะห์พบแบคทีเรียจำนวน 6 สายพันธุ์ และสามารถแบ่งออกเป็นสองกลุ่ม กลุ่มแรก คือ แบคทีเรียที่เป็นสาเหตุการเกิดโรคอาหารเป็นพิษในมนุษย์ ได้แก่ สายพันธุ์ Vibrio, Aeromonas และ Shewanella กลุ่มที่ 2 ได้แก่ สายพันธุ์ Kluyvera, Providencia และ Klebsiella ซึ่งตรวจพบจากการปนเปื้อนในขั้นตอนการแปรรูป การเก็บรักษา การขนส่งลำเลียง และการปรุงที่ไม่ถูกสุขลักษณะของร้านค้า ข้อมูลจากแผนภูมิต้นไม้พบว่าสายพันธุ์ Aeromonas มีความแตกต่างทางวิวัฒนาการเมื่อเทียบกับสายพันธุ์ Vibrio, Shewanella, Kluyvera, Providencia และ Klebsiella ความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการที่ได้จากแผนภูมิต้นไม้นี้ แสดงให้เห็นถึงความหลากหลายของการปนเปื้อนแบคทีเรียที่เป็นสาเหตุของการเกิดโรคอาหารเป็นพิษ ทั้งจากเชื้อที่มาจากแหล่งอาหารทะเล และการปนเปื้อนจากสิ่งแวดล้อม ข้อมูลที่ได้จากการศึกษานี้ จะเป็นประโยชน์ในการเฝ้าระวังในเชิงระบาดวิทยาจากโรคอาหารเป็นพิษที่มีสาเหตุมาจากการปนเปื้อนเชื้อแบคทีเรียจากอาหารทะเลต่อไป