ผลกระทบของแคดเมียมต่อรูปแบบการแสดงออกของเปปไทด์และค่าคะแนน biotyper ในการวิเคราะห์หาชนิดเชื้อ Escherichia coli O157:H7 ด้วยเครื่อง Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass-spectrometry (MALDI-TOF MS)

บทคัดย่อ

เครื่อง Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass-spectrometry (MALDI-TOF MS) เป็น high-throughput techniques ที่สามารถนำมาใช้ระบุชนิดของแบคทีเรียได้  ในประเทศไทยได้เริ่มมีการนำมาใช้แทนเทคนิคดั้งเดิมแล้ว และโดยที่ปัจจุบันยังพบการปนเปื้อนโลหะหนักต่างๆรวมทั้งแคดเมียมในอาหารและน้ำดื่มในประเทศไทย แต่ยังไม่มีการรายงานผลกระทบของแคดเมียมต่อรูปแบบเปปไทด์ที่แสดงออก รวมถึงผลกระทบต่อค่า biotyper score ที่ใช้ในการระบุจีนัสและสปีชีส์ของเชื้อแบคทีเรีย งานวิจัยนี้จึงมีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาผลของแคดเมียมที่มีต่อรูปแบบมวลเปปไทด์ และค่า biotyper score ของเชื้อ E. coli O157:H7 ที่เจริญในอาหารผสมแคดเมียมที่ความเข้มข้นมากกว่าและน้อยกว่าค่า metal tolerance test ได้แก่ช่วง 0.0016 - 1 มิลลิโมลาร์ แคดเมียมคลอไรด์ (CdCl₂ )โดยใช้เทคนิค MALDI-TOF MS จากการวิเคราะห์พบว่าแคดเมียมมีผลต่อรูปแบบมวลเปปไทด์ของเชื้อ E. coli O157:H7 โดยค่า biotyper score มีแนวโน้มลดลงเมื่อความเข้มข้นของแคดเมียมเพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญ (p<0.005)  แต่ยังสามารถวิเคราะห์หาจีนัสและสปีชีส์ได้อย่างถูกต้อง ความรู้จากการศึกษาครั้งนี้ทำให้เข้าใจผลของแคดเมียมต่อการวิเคราะห์ระบุชนิดของเชื้อแบคทีเรียก่อโรคด้วยเครื่อง MALDI-TOF MS โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการวิเคราะห์ตัวอย่างที่ได้มาจากพื้นที่ที่คาดว่ามีการปนเปื้อน