ความสอดคล้องของผลการตรวจระหว่างชุดน้ำยาทดสอบ CoviQuick v2.0 RTqPCR Kit และ AllplexTM 2019-nCoV assay สำหรับการตรวจหาการติดเชื้อ SARS-CoV-2

ผู้แต่ง

  • ศรสิทธิ์ จิรังดา -
  • ธัญชนก ประชากุล
  • อภิษฎา กฤษณสุวรรณ
  • ศุภรัตน์ ใบสูงเนิน
  • เกรียงไกร ไทยตระกูล

บทคัดย่อ

การตรวจวินิจฉัยการติดเชื้อ SARS-CoV-2 ด้วยชุดน้ำยาทดสอบ AllplexTM 2019-nCoV assay จำเป็นต้องมีขั้นตอนการสกัด RNA ในกระบวนการทดสอบมาตรฐานที่ให้บริการในปัจจุบัน เพื่อให้ได้วิธีการตรวจที่สะดวกและประหยัดเวลา ดังนั้นการศึกษานี้จึงใช้ชุดน้ำยาทดสอบ CoviQuick v2.0 RTqPCR Kit ซึ่งเป็นชุดน้ำยาที่สามารถใส่ตัวอย่างตรวจลงในน้ำยาตรวจได้โดยตรง ไม่ต้องมีขั้นตอนสกัด RNA และเปรียบเทียบความสอดคล้องของผลการตรวจหาเชื้อ SARS-CoV-2 ด้วยวิธี real-time RT-PCR ที่ได้จากทั้ง 2 ชุดน้ำยา ตรวจตัวอย่าง nasopharyngeal และ throat swab จำนวน 73 ตัวอย่าง เป็นตัวอย่างบวก 28 ตัวอย่าง ตัวอย่างลบ 45 ตัวอย่าง พบความสอดคล้องของผลตรวจระหว่างน้ำยาทั้ง 2 ร้อยละ 90.4 (66/73) ผลไม่สอดคล้องร้อยละ 9.6 (7/73) โดยชุดน้ำยา CoviQuick v2.0 RTqPCR Kit เป็นความสอดคล้องผลบวกร้อยละ 75.0 และความสอดคล้องผลลบร้อยละ 100.0 เมื่อเทียบกับน้ำยา AllplexTM 2019-nCoV assay นอกจากนี้ในตัวอย่างที่มีค่า cycle threshold (Ct) > 25 ความสอดคล้องผลบวกของชุดน้ำยา CoviQuick v2.0 RTqPCR Kit ลดลงเหลือร้อยละ 68.4 โดยที่ค่า Ct ของยีน N จากชุดน้ำยา CoviQuick v2.0 RTqPCR Kit จะให้ค่า Ct สูงกว่าอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ (p = 0.012) การใช้ชุดน้ำยา CoviQuick v2.0 RTqPCR Kit ในการตรวจหาเชื้อ SARS-CoV-2 อาจใช้แทนน้ำยาเดิมในกรณีตัวอย่างมีค่า Ct < 25 เนื่องจากสะดวกและลดระยะเวลาทดสอบ แต่ทั้งนี้ควรตรวจซ้ำในกลุ่มตัวอย่างที่ให้ผลลบและในผู้ป่วยที่มีอาการ

คำสำคัญ: SARS-CoV-2, COVID-19, real-time RT-PCR, AllplexTM 2019-nCoV assay, CoviQuick v2.0 RTqPCR Kit

เอกสารอ้างอิง

Zhu N, Zhang D, Wang W, Li X, Yang B, Song J, et al. A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019. N Engl J Med. 2020;382(8):727–33.

Merindol N, Pépin G, Marchand C, Rheault M, Peterson C, Poirier A, et al. SARS-CoV-2 detection by direct rRT-PCR without RNA extraction. J Clin Virol. 2020;128:1–4.

Yu L, Wu S, Hao X, Dong X, Mao L, Pelechano V, et al. Rapid Detection of COVID-19 Coronavirus Using a Reverse Transcriptional Loop-Mediated Isothermal Amplification (RT-LAMP) Diagnostic Platform. Clin Chem. 2020;66(7):975–7.

Barza R, Patel P, Sabatini L, Singh K. Use of a simplified sample processing step without RNA extraction for direct SARS-CoV-2 RT-PCR detection. J Clin Virol. 2020;132:1–3.

Tang YW, Schmitz JE, Persing DH, Stratton CW. Laboratory diagnosis of COVID-19: Current issues and challenges. J Clin Microbiol. 2020;58(6):1–9.

Rabi FA, Al Zoubi MS, Al-Nasser AD, Kasasbeh GA, Salameh DM. Sars-cov-2 and coronavirus disease 2019: What we know so far. Pathogens. 2020;9(3):1–14.

Yang HC, Liang YJ, Huang MC, Li LH, Lin CH, Wu JY, et al. A genome-wide study of preferential amplification/hybridization in microarray-based pooled DNA experiments. Nucleic Acids Res. 2006;34(15).

Binny RN, Priest P, French NP, Parry M, Lustig A, Hendy SC, et al. Sensitivity of Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction Tests for Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 through Time. J Infect Dis [Internet]. 2023;227(1):9–17. Available from: https://doi.org/10.1093/infdis/jiac317

He X, Lau EHY, Wu P, Deng X, Wang J, Hao X, et al. Temporal dynamics in viral shedding and transmissibility of COVID-19. Nat Med. 2020;26(5):672–5.

Owusu D, Pomeroy MA, Lewis NM, Wadhwa A, Yousaf AR, Whitaker B, et al. Persistent SARS-CoV-2 RNA Shedding without Evidence of Infectiousness: A Cohort Study of Individuals with COVID-19. J Infect Dis. 2021;224(8):1362–71.

Bergmans BJM, Reusken CBEM, van Oudheusden AJG, Godeke GJ, Bonačić Marinović AA, de Vries E, et al. Test, trace, isolate: evidence for declining SARS-CoV-2 PCR sensitivity in a clinical cohort. Diagn Microbiol Infect Dis. 2021;101(2).

1

ดาวน์โหลด

เผยแพร่แล้ว

2023-12-27

รูปแบบการอ้างอิง

จิรังดา ศ. ., ประชากุล ธ., กฤษณสุวรรณ อ., ใบสูงเนิน ศ., & ไทยตระกูล เ. (2023). ความสอดคล้องของผลการตรวจระหว่างชุดน้ำยาทดสอบ CoviQuick v2.0 RTqPCR Kit และ AllplexTM 2019-nCoV assay สำหรับการตรวจหาการติดเชื้อ SARS-CoV-2. วารสารโรงพยาบาลสระบุรี, 37(2), 266336/1–10. สืบค้น จาก https://he01.tci-thaijo.org/index.php/SHMJ/article/view/266336

ฉบับ

ปีที่ 37 ฉบับที่ 2 (2023): กรกฎาคม - ธันวาคม

ประเภทบทความ

Research Articles

สัญญาอนุญาต

ลิขสิทธิ์ (c) 2023 Sornsith Jirungda, Tunchanok Prachakul, Apisada Kitsanasuwan, Suparat Baisungnuen, Kreangkri Thaitrakull

Creative Commons License

อนุญาตภายใต้เงื่อนไข Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Journal of TCI is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International (CC BY-NC-ND 4.0) licence, unless otherwise stated. Please read our Policies page for more information.