รูปแบบการดื้อยาต้านจุลชีพของเชื้อซาลโมเนลลา เอ็นเตอริทิดิส ที่แยกได้จากฟาร์มไก่เนื้อในภาคตะวันออกเฉียงเหนือของไทย

Main Article Content

Nusara Suwannachot
Warisa Katephan
Suphattra Jittimanee
Patchara Phuektes

บทคัดย่อ

วัตถุประสงค์: การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษารูปแบบการดื้อยาต้านจุลชีพของเชื้อซาลโมเนลลา เอนเตอริทิดิส ที่แยกได้จากฟาร์มไก่เนื้อที่ตั้งอยู่ในภาคตะวันออกเฉียงเหนือของไทย ในระหว่าง ปี พ.ศ. 2558-2561 และตรวจสอบการมียีนดื้อยาโคลิสติน (mcr) ในเชื้อที่แยกได้


วัสดุ อุปกรณ์ และวิธีการ: ศึกษาจากเชื้อซาลโมเนลลา serogroup D จำนวน 30 เชื้อ ที่แยกได้จากตัวอย่าง boot swab จำนวน 30 ตัวอย่าง     โดยเป็นตัวอย่างจากฟาร์มไก่เนื้อที่ได้รับการรับรองมาตรฐานการปฏิบัติทางการเกษตรที่ดี จำนวน 30 ฟาร์ม พิสูจน์ซีโรวาร์ซาลโมเนลลา เอนเตอริทิดิส โดยการตรวจวิเคราะห์ยีน SdfI ด้วยวิธีพีซีอาร์ ทดสอบความไวต่อยาต้านจุลชีพ 27 ชนิด ที่อยู่ในกลุ่มยา 12 กลุ่ม โดยใช้วิธี microbroth dilution method ด้วยเครื่องทดสอบความไวของเชื้อต่อยาต้านจุลชีพแบบอัตโนมัติ และตรวจหายีนดื้อยาโคลิสติน (mcr) ด้วยวิธีพีซีอาร์


ผลการศึกษา: ผลการตรวจวิเคราะห์ด้วยวิธีพีซีอาร์พบว่าเชื้อซาลโมเนลลา serogroup D ทั้ง 30 ไอโซเลท เป็นเชื้อซาลโมเนลลา เอนเตอริทิดิส ที่แยกได้ในแต่ละฟาร์ม  ผลการทดสอบความไวต่อยาต้านจุลชีพพบว่าเชื้อมีการดื้อต่อยา ampicillin (100%), cephalexin (90%) และ nitrofurantoin (100%) และให้ผล intermediate susceptible ต่อยา ticarcillin/clavulanate (100%), ciprofloxacin (100%), nitrofurantoin (96.7%) และ amoxicillin/clavulanate (36.7%) เชื้อส่วนใหญ่ (90%) มีรูปแบบการดื้อยา 2 ชนิดร่วมกัน คือ ampicillin และ cephalexin พบเชื้อดื้อยาหลายขนานเพียง 1 ไอโซเลท (3.33%) โดยพบการดื้อยาร่วมกัน 3 ชนิดคือ ampicillin, cephalexin  และ nitrofurantoin  ผลการวิเคราะห์ค่า multiple antibiotic resistance (MAR) index พบว่าเชื้อส่วนใหญ่ (90%) มีค่า 0.07 โดยพบค่าสูงสุดเท่ากับ 0.11 ในไอโซเลทที่ดื้อยาหลายขนาน พบยีน mcr-1 ในเชื้อ 3 ไอโซเลทซึ่งเป็นเชื้อที่ไม่ดื้อยาหลายขนาน


ข้อสรุป: อัตราการพบเชื้อดื้อยาหลายขนานในเชื้อซาลโมเนลลา เอนเตอริทิดิส ที่ศึกษามีอัตราที่ต่ำ ซึ่งอาจเป็นผลมาจากการควบคุมการใช้ยาต้านจุลชีพอย่างเหมาะสมในฟาร์มไก่เนื้อที่ได้รับการรับรองมาตรฐานการปฏิบัติทางการเกษตรที่ดี อย่างไรก็ตามการพบว่าเชื้อทุกไอโซเลทมีความไวต่อยา ciprofloxacin ในระดับที่ลดลง และการพบยีน mcr-1 บ่งชี้ถึงความจำเป็นในการตรวจติดตามวิเคราะห์รูปแบบการดื้อยา และยีน mcr ของเชื้อ ซาลโมเนลลา เอนเตอริทิดิส ในสัตว์ปีกอย่างต่อเนื่อง

Article Details

ประเภทบทความ
บทความวิจัย

เอกสารอ้างอิง

Akinola SA, Mwanza M, Ateba CN, 2019. Occurrence, genetic diversities and antibiotic resistance profiles of Salmonella serovars isolated from chickens. Infect Drug Resist 24, 3327-3342.

Alvarez J, Sota M, Vivanco AB, Perales I, Cisterna R, Rementeria A, Garaizar J, 2004. Development of a multiplex PCR technique for detection and epidemiological typing of Salmonella in human clinical samples. J Clin Microbiol 42(4), 1734-1738.

Bangtrakulnonth A, Pornreongwong S, Pulsrikarn C, Sawanpanyalert P, Hendriksen RS, Wong DM, Aarestrup FM, 2004. Salmonella serovars from humans and other sources in Thailand, 1993–2002. Emerg Infect Dis 10(1), 131-136.

Batz MB, Hoffma Batz MB, Hoffmann S, Morris Jr JG, 2012. Ranking the disease burden of 14 pathogens in food sources in the United States using attribution data from outbreak investigations and expert elicitation. J Food Prot 75(7), 1278-1291.

Bertelloni F, Cagnoli G, Turchi B, Ebani V, 2022. Low Level of Colistin Resistance and mcr Genes Presence in Salmonella spp.: Evaluation of Isolates Collected between 2000 and 2020 from Animals and Environment. Antibiotics (Basel, Switzerland) 11(2), 272. https://doi.org/10.3390/antibiotics11020272

Borowiak M, Baumann B, Fischer J, Thomas K, Deneke C, Hammerl J, Szabo I, Malorny B, 2020. Development of a novel mcr-6 to mcr-9 multiplex pcr and assessment of mcr-1 to mcr-9 occurrence in colistin-resistant salmonella enterica isolates from environment, feed, animals and food (2011-2018) in Germany. Front Microbiol. doi: 10.3389/fmicb.2020.00080.

Campioni F, Cao G, Kastanis G, Janies DA, Bergamini AM, Rodrigues DD, Stones R, Brown E, Allard MW, Falcão JP, 2018. Changing of the genomic pattern of Salmonella Enteritidis strains isolated in Brazil over a 48 year-period revealed by whole genome SNP analyses. Sci Rep 8(1), 1-7.

Campioni F, Zoldan MM, Falcão JP, 2014. Characterization of Salmonella Enteritidis strains isolated from poultry and farm environments in Brazil. Epidemiol Infect 142(7), 1403-1410.

Cardoso MO, Ribeiro AR, Santos LR, Pilotto F, de Moraes HL, Salle CT, Rocha SL, Nascimento VP, 2006. Antibiotic resistance in Salmonella Enteritidis isolated from broiler carcasses. Braz J Microbiol 37, 368-371.

Carroll LM, Gaballa A, Guldimann C, Sullivan G, Henderson LO, Wiedmann M, 2019. Identification of novel mobilized colistin resistance gene mcr-9 in a multidrug-resistant, colistin-susceptible Salmonella enterica serotype Typhimurium isolate. MBio 10(3), e00853-19.

Chen HM, Wang Y, Su LH, Chiu CH, 2013. Nontyphoid Salmonella infection: microbiology, clinical features, and antimicrobial therapy. Pediatr Neonatol 54(3), 147-152.

Chotinan S, Tadee P, 2015. Epidemiological survey of S. Enteritidis Pulsotypes from salmonellosis outbreak in Chiang Mai and Samut Songkhram Provinces, Thailand. Chiang Mai V J 13(2), 73-80.

Clinical and Laboratory Standarda Institute (CLSI), A. CLSI AST News Update. Retrieved February 12, 2021, from https://www.nih.org.pk/wpcontent/uploads/2021/ 02/ CLSI-2020.pdf

Crump JA, Sjölund-Karlsson M, Gordon MA, Parry CM, 2015. Epidemiology, clinical presentation, laboratory diagnosis, antimicrobial resistance, and antimicrobial management of invasive Salmonella infections. Clin Microbiol Rev 28(4), 901-937.

Cui L, Wang X, Zhao Y, Peng Z, Gao P, Cao Z, Feng J, Zhang F, Guo K, Wu M, Chen H, 2021. Virulence comparison of Salmonella enterica subsp. enterica isolates from chicken and whole genome analysis of the high virulent strain S. Enteritidis 211. Microorganisms. 9(11), 2239. https://doi.org/10.3390/microorganisms9112239

Dashti, A, Jadaon M, Abdulsamad A, Dashti H, 2009. Heat treatment of bacteria: a simple method of DNA extraction for molecular techniques. Kuwait Med J. 41 (2), 117-122.

DLD. Control Salmonella in Poultry. Notification of the Department of Livestock Development. The Ministry of Agriculture and Cooperatives, Thailand. 2010.

Founou RC, Founou LL, Essack SY, 2017. Clinical and economic impact of antibiotic resistance in developing countries: A systematic review and meta-analysis. PLoS One 12(12), e0189621. doi: 10.1371/journal.pone.0189621.

Grimont, P.A.D., and F.X. Weill, 2007. Antigenic formulae of the Salmonella serovars, (9th ed.). World Health Organization Collaborating Center for Reference and Research on Salmonella, Institut Pasteur.

Gulen TA, Guner R, Celikbilek N, Keske S, Tasyaran M, 2015. Clinical importance and cost of bacteremia caused by nosocomial multi drug resistant Acinetobacter baumannii. Int J Infect Dis 38, 32-35.

Hengkrawit K, Tangjade C, 2022. Prevalence and trends in antimicrobial susceptibility patterns of multi-drug-resistance non-typhoidal Salmonella in central Thailand, 2012–2019. Infect Drug Resist 15, 1305-1315.

Kipper D, Mascitti AK, De Carli S, Carneiro AM, Streck AF, Fonseca AS, Ikuta N, Lunge VR, 2022. Emergence, dissemination and antimicrobial resistance of the main poultry-associated Salmonella Serovars in Brazil. Vet Sci 9(8), 405. https://doi.org/10.3390/vetsci9080405

Li J, Shi X, Yin W, Wang Y, Shen Z, Ding S, Wang S, 2017. A Multiplex SYBR Green Real-Time PCR Assay for the Detection of Three Colistin Resistance Genes from Cultured Bacteria, Feces, and Environment Samples. Front Microbiol 8, 2078.

Liang Z, Ke B, Deng X, Liang J, Ran L, Lu L, He D, Huang Q, Ke C, Li Z, Yu H, 2015. Serotypes, seasonal trends, and antibiotic resistance of non-typhoidal Salmonella from human patients in Guangdong Province, China, 2009–2012. BMC Infect Dis 15(1), 1-9.

Liu Y, Wang Y, Walsh T, Yi L, Zhang R, Spencer J, Doi Y, Tian G, Dong B, Huang X, Yu L, Gu D, Ren H, Chen X, Lv L, He D, Zhou H, Liang Z, Liu J, Shen J, 2016. Emergence of plasmid-mediated colistin resistance mechanism MCR-1 in animals and human beings in China: a microbiological and molecular biological study. Lancet Infect Dis 16(2), 161-168.

Lu Y, Zhao H, Sun J, Liu Y, Zhou X, Beier RC, Wu G, Hou X, 2014. Characterization of multidrug-resistant Salmonella enterica serovars Indiana and Enteritidis from chickens in Eastern China. PLoS One 9(5), e96050.

Na lampang K, Chongsuvivatwong V, Kitikoon V, 2007. Pattern and determinant of antibiotics used on broiler farms in Songkhla province, southern Thailand. Trop Anim Health Prod 39(5), 355-361.

Na Lampang, K., Chailangkarn, S., Padungtod, P, 2014. Prevalence and antimicrobial resistance of salmonella serovars in chicken farm, Chiang Mai and Lamphun province, Northern of Thailand. Chiang Mai V J, 12 (2), 85-93.

Osei Sekyere J, 2018. Genomic insights into nitrofurantoin resistance mechanisms and epidemiology in clinical Enterobacteriaceae. Future Sci OA 4(5), FSO293.

Perestrelo S, Thongkamkoon P, Narongsak W, Amavisit P, 2016. Antimicrobial resistance profiles of Salmonella isolated from poultry farms in central Thailand. J Kasetsart Vet 26(3), 119-130.

Phongaran D, Khang-Air S, Angkititrakul S, 2019. Molecular epidemiology and antimicrobial resistance of Salmonella isolates from broilers and pigs in Thailand. Vet World 12(8), 1311-1318.

Phongvivat S, FAO/WHO, 2004. Nitrofurans case study: Thailand’s experience. InJoint FAO/WHO technical workshop on residues of substances without ADI/MRL in food, Bangkok, Thailand 2004.

Pławińska-Czarnak J, Wódz K, Kizerwetter-Świda M, Bogdan J, Kwieciński P, Nowak T, Strzałkowska Z, Anusz K, 2022. Multi-drug resistance to Salmonella spp. when isolated from raw meat products. Antibiotics 11(7), 876. doi.org/10.3390/antibiotics 11070876.

Pumart P, Phodha T, Thamlikitkul V, Riewpaiboon A, Prakongsai P, Limwattananon S, 2012. Health and economic impacts of antimicrobial resistance in Thailand. J Health Serv Res Policy 6(3), 352-360.

Punchihewage-Don AJ, Hawkins J, Adnan AM, Hashem F, Parveen S, 2022. The outbreaks and prevalence of antimicrobial resistant Salmonella in poultry in the United States: An overview. Heliyon 8(11), e11571. doi: 10.1016/j.heliyon.2022.e11571.

Pungpian C, Lee S, Trongjit S, Sinwat N, Angkititrakul S, Prathan R, Srisanga S, Chuanchuen R, 2021. Colistin resistance and plasmid-mediated mcr genes in Escherichia coli and Salmonella isolated from pigs, pig carcass and pork in Thailand, Lao PDR and Cambodia border provinces. J Vet Sci 22(5), e68. https://doi.org/10.4142/jvs.2021.22.e68

Rebelo A, Bortolaia V, Kjeldgaard J, Pedersen S, Leekitcharoenphon P, Hansen I, Guerra B, Malorny B, Borowiak M, Hammerl J, Battisti A, Franco A, Alba P, Perrin-Guyomard A, Granier S, De Frutos Escobar C, Malhotra-Kumar S, Villa L, Carattoli A, Hendriksen R, 2018. Multiplex PCR for detection of plasmid-mediated colistin resistance determinants, mcr-1, mcr-2, mcr-3, mcr-4 and mcr-5 for surveillance purposes. Euro Surveill 23(6), 17-00672.

Sakdinun P, Sriwongsa, Wongmuk S, 2018. Detection of colistin resistance and mcr-1 gene in Salmonella isolated from feces of poultry in western Thailand during 2013-2016. KKU Vet J 28 (1).

Sakdinun, P., Sriwongsa, N., Paiboonkunkon, K. Antimicrobial susceptibility and resistance genes in Salmonella isolated from feces of broiler in western Thailand. http://vrdwp.dld.go.th/webnew/images/stories/report/research/2559_AMR_salmonella_feces.pdf

Shang K, Wei B, Cha SY, Zhang JF, Park JY, Lee YJ, Jang HK, Kang M, 2021. The occurrence of antimicrobial-resistant Salmonella enterica in hatcheries and dissemination in an integrated broiler chicken operation in Korea. Animals 11(1), 154. https://doi.org/10.3390/ani11010154

Skov RL, Monnet DL, 2016. Plasmid-mediated colistin resistance (mcr-1 gene): three months later, the story unfolds. Euro Surveill 21(9), 30155.

Soria MC, Soria MA, Bueno DJ, Godano EI, Gómez SC, ViaButron IA, Padin VM, Rogé AD, 2017. Salmonella spp. contamination in commercial layer hen farms using different types of samples and detection methods. Poult Sci, 96(8):2820-2830.

Suzuki S, 1994. Pathogenicity of Salmonella enteritidis in poultry. Int J Food Microbiol 21(1-2), 89–105.

Utrarachkij F, Nakajima C, Siripanichgon K, Changkaew K, Thongpanich Y, Pornraungwong S, Suthienkul O, Suzuki Y, 2016. Genetic diversity and antimicrobial resistance pattern of Salmonella enterica serovar Enteritidis clinical isolates in Thailand. J Infect Chemother 22(4), 209-215.

Van Boeckel TP, Thanapongtharm W, Robinson T, D'Aietti L, Gilbert M, 2012. Predicting the distribution of intensive poultry farming in Thailand. Agric Ecosyst Environ 149, 144-153.

Wang C, Feng Y, Liu L, Wei L, Kang M, Zong Z, 2020. Identification of novel mobile colistin resistance gene mcr-10. Emerg Microbes Infect 9(1), 508-516.

Wang R, Van Dorp L, Shaw LP, Bradley P, Wang Q, Wang X, Jin L, Zhang Q, Liu Y, Rieux A, Dorai-Schneiders T, 2018. The global distribution and spread of the mobilized colistin resistance gene mcr-1. Nat Commun 9(1), 1179.

Wang X, Wang H, Li T, Liu F, Cheng Y, Guo X, Wen G, Luo Q, Shao H, Pan Z, Zhang T, 2020. Characterization of Salmonella spp. isolated from chickens in Central China. BMC Vet Res 16(1), 1-9.

Wongsrichai S, Phuektes P, Jittimanee S, 2021. Multidrug-resistance and mobile colistin resistance (mcr) genes of Salmonella isolates from pork in Thailand during 2014-2017: comparison between two different types of slaughterhouses and retails. Vet Integr Sci 19(3), 333-348.

Wongsuvan G, Wuthiekanun V, Hinjoy S, Day NP, Limmathurotsakul D, 2018. Antibiotic use in poultry: a survey of eight farms in Thailand. Bull World Health Organ 96(2), 94-100.

World Health Organization, 2014. Antimicrobial resistance global report on surveillance: 2014 summary (No. WHO/HSE/PED/AIP/2014.2). World Health Organization.

Xavier B, Lammens C, Ruhal R, Kumar-Singh S, Butaye P, Goossens H, Malhotra-Kumar S, 2016. Identification of a novel plasmid-mediated colistin-resistance gene, mcr-2, in Escherichia coli, Belgium, June 2016. Euro Surveill 21(27).

Yaghoubi S, Zekiy AO, Krutova M, Gholami M, Kouhsari E, Sholeh M, Ghafouri Z, Maleki F, 2021. Tigecycline antibacterial activity, clinical effectiveness, and mechanisms and epidemiology of resistance: narrative review. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 41(7), 1003-1022.

Yu X, Zhu H, Bo Y, Li Y, Zhang Y, Liu Y, Zhang J, Jiang L, Chen G, Zhang X, 2021. Prevalence and antimicrobial resistance of Salmonella enterica subspecies enterica serovar Enteritidis isolated from broiler chickens in Shandong Province, China, 2013–2018. Poult Sci 100(2), 1016-1023.

Yue M, Li X, Liu D, Hu X, 2020. Serotypes, antibiotic resistance, and virulence genes of Salmonella in children with diarrhea. J Clin Lab Anal 34(12), e23525.

Yue M., Liu D., Li X., Jin S., Hu X., Zhao X., Wu Y, 2022. Epidemiology, Serotype and Resistance of Salmonella Isolates from a Children’s Hospital in Hangzhou, Zhejiang, China, 2006–2021. Infect Drug Resist, 4735-4748.