RT-PCR Survey of Emerging Paramyxoviruses in Cave-dwelling Bats
Keywords:
ค้างคาว, แหล่งรังโรคในธรรมชาติ, พารามิกโซไวรัส, ปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรสแบบย้อนกลับ, ประเทศไทย, โรคสัตว์สู่คน, bats, natural reservoir, paramyxovirus, RT-PCR, Thailand, zoonosesAbstract
บทคัดย่อ
ค้างคาวเป็นพาหะของพารามิกโซไวรัสหลายตัว รวมทั้ง เฮนดราไวรัส และ นิปาห์ไวรัส โดยไวรัสทั้งสองชนิดนี้สามารถก่อให้เกิดโรค จนเป็นสาเหตุการตายของมนุษย์และสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม เนื่องจากไวรัสทั้งสองชนิดมีลักษณะที่แตกต่างจากพารามิกโซไวรัสตัวอื่นที่พบก่อน หน้านี้จึงถูกจำแนกออกมาเป็นสกุลใหม่ คือ เฮนิปาไวรัส คณะผู้วิจัยได้รายงานผลการสำรวจในค้างคาวถ้ำกินแมลงในประเทศไทยเพื่อหาเฮนิ ปาไวรัส โดยเก็บตัวอย่างปัสสาวะจากค้างคาว ๖ สายพันธุ์ ในถ้ำ ๙ แห่ง ตามพื้นที่ภาคเหนือและภาคใต้ (เชียงใหม่ นครสวรรค์ สงขลา และ สตูล) การตรวจหาไวรัสใช้วิธีปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรสแบบย้อนกลับ โดยใช้ไพรเมอร์ที่จำเพาะต่ออาร์เอ็นเอพอลิเมอเรสยีนของเฮนิปาไวรัส มาเป็นไพเมอร์หาไวรัส พบว่าตัวอย่างปัสสาวะค้างคาวจากถ้ำ ๗ แห่ง (จาก ๙ ถ้ำ) ให้ผลบวกต่อการตรวจหาด้วยวิธีดังกล่าว เมื่อนำดีเอ็นเอ สายใหม่ที่ได้จากขบวนการปฏิกริยาลูกโซ่มาหาลำดับเบส พบว่า เป็นสายลำดับเบสของพารามิกโซไวรัสชนิดที่ยังไม่เคยศึกษาคุณลักษณะมา ก่อน สามารถแบ่งความแตกต่างทางลักษณะพันธุกรรมได้ ๓ กลุ่ม และ ๗ แบบพันธุธรรม เมื่อนำลำดับแอลโปรตีนมาของตัวอย่างที่ให้ผลบวก และมีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกันมาวิเคราะห์หาสายสัมพันธ์พบว่า พารามิกโซไวรัสดังกล่าวมีความสัมพันธ์กับเบลองไวรัสและเจไวรัส การศึกษานี้ เป็นการรายงานครั้งแรกของการสำรวจพบพารามิกโซไวรัสชนิดต่าง ๆ ในค้างคาวถ้ำ และ ยังเป็นจุดสำคัญที่นำไปสู่การสำรวจทางระบาด วิทยาในค้างคาวต่อไป
คำสำคัญ : ค้างคาว, แหล่งรังโรคในธรรมชาติ, พารามิกโซไวรัส, ปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรสแบบย้อนกลับ, ประเทศไทย, โรคสัตว์สู่คน
Abstract
Bats are the reservoir hosts for several Paramyxoviruses including two serious zoonotic viruses, Hendra virus and Nipah virus which are responsible for fatal infections in animals and humans. These two viruses are sufficiently different from previously described Paramyxoviruses and are included in a new genus, Henipavirus. We report here a survey of cave-dwelling, insectivorous bats in Thailand for the presence of henipaviruses. Pooled urine samples were collected in nine caves inhabited by six different bat species in the northern (Chiangmai and Nakornsawan) and southern (Songkla and Satoon) provinces of Thailand. A reverse transcription PCR (RT-PCR) assay using henipavirus-specific primers derived from the conserved region of the RNA polymerase (L) gene was used to detect known and unknown viruses in this genus. Samples from seven out of nine caves surveyed tested positive by RT-PCR. Nucleotide sequences of the PCR bands revealed the presence of diverse strains (three clusters and seven divergent genotypes) of previously uncharacterised paramyxovirus(es). Phylogenetic analysis based on the deduced L protein sequence revealed close correlations between the positive samples and the recently described but unclassified paramyxoviruses: Beilong virus and J-virus. This is the first report on the prevalence of paramyxovirus variants in cave-dwelling bats and highlights the importance of further epidemiological surveillance in bats.
Keywords : bats, natural reservoir, paramyxovirus, RT-PCR, Thailand, zoonoses
