Analysis on Differentially Expressed Genes of Muscle Tissues in Rugao Chicken at the Ages of 2 and 12 Weeks by Microarray

Authors

  • De Qin Luan College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China.
  • Guo Bin Chang College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China.
  • Ting Zhen College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China.
  • Zheng Yang Huang College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China.
  • Wei Zhou College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China.
  • Yan Liu Institute of Agricultural Resources and Environment Research/Engineering Research Center for Digital Agriculture, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Nanjing 210014, China.
  • Guo Hong Chen College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China.

Keywords:

ไก่, GeneChip, กล้ามเนื้อ, รูปแบบการแสดงออกของยีน, real-time quantitative PCR, chicken, muscle tissues, gene expression profile

Abstract

บทคัดย่อ

เทคนิคไมโครอะเรย์ซึ่งประกอบด้วย 13319 probes ถูกนำมาใช้ในสร้างรูปแบบ เพื่อศึกษาการแสดงของยีนในระยะการพัฒนาในกล้ามเนื้อของไก่สายพันธุ์ Rugao และศึกษากลไกระดับอณูชีวโมเลกุลที่เกี่ยวข้องกับกล้ามเนื้อในไก่อายุ 2 และ 12 สัปดาห์. ทำการศึกษาการแสดงออกของยีนจำนวน 208 ชนิด ซึ่งประกอบด้วย 108 known genes 94 up-regulated และ 114 down-regulated ซึ่งยีนดังกล่าวมีบทบาทในการเจริญ กลไกระดับอณูชีวโมเลกุล เมตาบอลิสมของไขมัน การงอกขยายของเซลล์ transcription and splicing factor การสังเคราะห์และการสลายโปรตีน ในขณะเดียวกันยีนบางชนิดยังไม่มีรายงาน การแสดงออกของยีนที่แตกต่าง 4 ชนิดถูกทดสอบโดยวิธี realtimequantitative PCR และผลการแสดงออกแสดงในรูปแบบชอง GeneChip ซึ่งเป็นเทคโนโลยีที่ใหม่สำหรับการคัดเลือกสายพันธุ์ ของไกพันธุ์พื้นเมืองในประเทศจีนได้

คำสำคัญ: ไก่ GeneChip กล้ามเนื้อ รูปแบบการแสดงออกของยีน real-time quantitative PCR

 

Abstract

Microarray containing 13319 probes was used to construct gene expression profiles in order to screendifferentially expressed genes of muscle tissues in Rugao chicken and investigate the molecular mechanism relatedwith muscle tissue traits at 2 and 12 weeks old of chicken. Two hundred and eight differentially expressed genes, ofwhich 108 were known genes, 94 up-regulated, 114 down-regulated were involved in growth, molecular mechanism,fat metabolism, cell proliferation, transcription and splicing factor, protein synthesis and degradation. Meanwhile,some genes of these differentially expressed genes that had no annotation in GenBank were screened out, they werepresumed to be unknown new genes. The differential expressions of 4 genes were confirmed by real-time quantitativePCR and the results indicated that the expression changes of these genes were generally consistent with the results ofGeneChip, a technology that could be used in breeding and selection of Chinese native chicken breeds.

Keywords: chicken, GeneChip, muscle tissues, gene expression profile, real-time quantitative PCR

Downloads

How to Cite

Luan, D. Q., Chang, G. B., Zhen, T., Huang, Z. Y., Zhou, W., Liu, Y., & Chen, G. H. (2013). Analysis on Differentially Expressed Genes of Muscle Tissues in Rugao Chicken at the Ages of 2 and 12 Weeks by Microarray. The Thai Journal of Veterinary Medicine, 41(3), 299–308. Retrieved from https://he01.tci-thaijo.org/index.php/tjvm/article/view/9556

Issue

Vol. 41 No. 3 (2011): September

Section

Original Articles