Evaluation of Microsatellite Polymorphism and Genetic Variability in Thai Ridgeback and Bangkaew Dogs
Keywords:
สุนัขบางแก้ว, สุนัข, ความหลากหลายทางพันธุกรรม, ไมโครแซทเทิลไลท์, สุนัขไทยหลังอาน, Bangkaew dogs, dog, genetic variability, microsatellite, Thai Ridgeback dogsAbstract
บทคัดย่อ
ต้นกำเนิดของสุนัขพบว่ามาจากสุนัขต้นกำเนิดจำนวนจำกัด ทำให้เกิดปัญหาการผสมเลือดชิดและโรคทางพันธุกรรมภายในสุนัขสายพันธุ์เดียวกันหรือต่างสายพันธุ์ สุนัขไทยหลังอานและสุนัขบางแก้วเป็นสุนัขพื้นเมืองที่คาดว่าจะมีต้นกำเนิดในประเทศไทย จากการศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมในสุนัขไทย (สุนัขไทยหลังอาน 39 ตัว สุนัขบางแก้ว 82 ตัว) โดยใช้เครื่องหมายดีเอ็นเอไมโครแซทเทิลไลท์จำนวน 12 เครื่องหมาย เครื่องหมายดีเอ็นเอชนิดนี้พบว่ามีความหลากหลายและกระจายอยู่ทั่วทั้งจีโนมในสุนัข ผลจากการศึกษาเครื่องหมายดีเอ็นเอเหล่านี้พบจำนวนอัลลีล ค่า observed heterozygosity (HO) ค่า expected heterozygosity (He) และค่า polymorphicinformation content (PIC) สูงทั้งในสุนัขไทยหลังอานและบางแก้ว ค่าเฉลี่ยของ Ho, He และ PIC เท่ากับ 0.72, 0.77, 0.73 ในสุนัขบางแก้ว และ 0.81, 0.78, 0.75 ในสุนัขไทยหลังอาน ค่าเฉลี่ยของอัตราเลือดชิดเท่ากับ 0.072 และ -0.019 ในสุนัขบางแก้วและสุนัขไทยหลังอานตามลำดับ ค่าอัตราเลือดชิดที่ต่ำและติดลบบ่งบอกว่าไม่น่ามีปัญหาการผสมเลือดชิดในสุนัขเหล่านี้ โดยเฉพาะในสุนัขไทยหลังอาน ข้อมูลที่ได้จากการศึกษาในครั้งนี้สามารถนำไปใช้ศึกษาลักษณะทางพันธุกรรมในสุนัขไทยเพื่อสำรวจโครงสร้างทางประชากรในสุนัขเหล่านี้ต่อไป
คำสำคัญ: สุนัขบางแก้ว สุนัข ความหลากหลายทางพันธุกรรม ไมโครแซทเทิลไลท์ สุนัขไทยหลังอาน
Abstract
The origin of dogs came from the limited number of founders leading to inbreeding or genetic diseasewithin or among breeds. Thai Ridgeback (TR) and Bangkaew (BK) dogs were the only native dog breeds that webelieved to originate in Thailand. The study of genetic variability in Thai dogs (39 Thai Ridgeback dogs, 82 Bangkaewdogs) was defined by using 12 microsatellite markers. These DNA markers were highly informative and distributedthrough the canine genome. The result from these markers revealed the higher number of alleles, observedheterozygosity (Ho), expected heterozygosity (He) and polymorphic information content (PIC) in TR and BK dogs.The average Ho, He and PIC were 0.72, 0.77, 0.73 in Bangkaew and 0.81, 0.78, 0.75 in Thai Ridgeback dogs. Theaverage inbreeding coefficient was 0.072 and -0.019 in Bangkaew and Thai Ridgeback dogs, respectively. The low andnegative inbreeding coefficient values revealed no inbreeding problem especially in Thai Ridgeback dog. Theinformation generated in this study could be used for further genetic study in Thai dogs and to investigate thepopulation structure in these dog breeds.
Keywords: Bangkaew dogs, dog, genetic variability, microsatellite, Thai Ridgeback dogs
