โครงการหาลำดับนิวคลีโอไทด์ ในจีโนมของเชื้อมาลาเรีย Plasmodium falciparum

Abstract

บทความนี้ได้รวบรวมความเป็นมาของโครงการหาลำดับนิวคลีโอไทด์ในจีโนมของเชื้อมาลาเรีย Plasmodium falciparum ซึ่งถูกตั้งขึ้นในชื่อของ The Wellcome Trust Malaria Genome Mapping Project ในปี พ.ศ. 2536 ด้วยการสนับสนุนจาก Wellcome Trust (อังกฤษ) การศึกษาโครโมโซมเริ่มจากการแยกโครโมโซมของเชื้อมาลาเรียด้วยเทคนิค pulsed-field gel electrophoresis และนำไปโคลนเข้าสู่พลาสมิด เลือกพลาสมิดที่มีชิ้นโครโมโซมแทรกอยู่โดยใช้ sequence tagged site (STS) แล้วนำไปสร้างแผนที่โครโมโซม ด้วยการสนับสนุนด้านการเงินจากแหล่งเงินทุนหลายแหล่ง ทำให้โครงการในปัจจุบันมีขนาดใหญ่ขึ้นครอบคลุมสถาบันวิจัยสี่แห่ง ได้แก่ Sanger Centre (อังกฤษ), Institute for Genomic Research, Naval Medical Research Institute และ Stanford University (สหรัฐอเมริกา) เพื่อร่วมมือกันในการหาลำดับเบสของโครโมโซมทั้ง 14 แท่งของเชื้อมาลาเรีย สถาบันทั้งสี่แห่งได้รายงานแล้วว่า การหาลำดับเบสของโครโมโซมแท่งที่ 2 และ 3 เสร็จสมบูรณ์แล้ว ส่วนโครโมโซมแท่งที่ 1, 4, 9, 10, 11, 12 และ 14 นั้นอยู่ในขั้นตอนสุดท้ายของการหาลำดับเบส ส่วนโครโมโซมที่เหลือ ได้แก่ แท่งที่ 5, 6, 7, 8 และ 13 อยู่ในระหว่างการหาลำดับเบส นักวิทยาศาสตร์ต่างหวังว่าลำดับเบสที่ได้จากการศึกษาตามโครงการนี้จะสามารถช่วยให้การศึกษาเชื้อมาลาเรียได้ถี่ถ้วนขึ้นในยุคหลังการศึกษาจีโนม และเพื่อให้ความรู้เหล่านี้ถูกรวบรวมไว้ในแหล่งเดียวกันจึงมีการสร้างฐานข้อมูลชื่อ PlasmoDB สำหรับเก็บข้อมูลดังกล่าว